Protein–RNA interactions for Protein: Q80U62

Rubcn, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnQ80U62 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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RubcnQ80U62 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RubcnQ80U62 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RubcnQ80U62 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RubcnQ80U62 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RubcnQ80U62 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RubcnQ80U62 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RubcnQ80U62 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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RubcnQ80U62 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RubcnQ80U62 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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RubcnQ80U62 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RubcnQ80U62 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RubcnQ80U62 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RubcnQ80U62 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RubcnQ80U62 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RubcnQ80U62 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RubcnQ80U62 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RubcnQ80U62 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RubcnQ80U62 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RubcnQ80U62 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RubcnQ80U62 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RubcnQ80U62 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RubcnQ80U62 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RubcnQ80U62 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RubcnQ80U62 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RubcnQ80U62 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RubcnQ80U62 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RubcnQ80U62 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RubcnQ80U62 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RubcnQ80U62 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RubcnQ80U62 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RubcnQ80U62 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RubcnQ80U62 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RubcnQ80U62 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RubcnQ80U62 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RubcnQ80U62 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RubcnQ80U62 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RubcnQ80U62 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RubcnQ80U62 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RubcnQ80U62 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RubcnQ80U62 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RubcnQ80U62 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RubcnQ80U62 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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