Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Avl9Q80U56 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Avl9Q80U56 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms