Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Cul9Q80TT8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms