Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
NischQ80TM9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
NischQ80TM9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
NischQ80TM9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
NischQ80TM9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
NischQ80TM9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
NischQ80TM9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
NischQ80TM9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
NischQ80TM9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
NischQ80TM9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
NischQ80TM9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
NischQ80TM9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
NischQ80TM9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
NischQ80TM9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
NischQ80TM9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
NischQ80TM9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
NischQ80TM9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
NischQ80TM9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
NischQ80TM9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
NischQ80TM9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
NischQ80TM9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
NischQ80TM9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
NischQ80TM9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
NischQ80TM9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
NischQ80TM9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
NischQ80TM9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
NischQ80TM9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
NischQ80TM9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
NischQ80TM9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
NischQ80TM9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
NischQ80TM9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC40.05■■■■■ 4
NischQ80TM9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
NischQ80TM9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
NischQ80TM9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
NischQ80TM9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
NischQ80TM9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
NischQ80TM9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
NischQ80TM9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
NischQ80TM9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
NischQ80TM9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
NischQ80TM9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
NischQ80TM9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
NischQ80TM9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
NischQ80TM9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
NischQ80TM9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
NischQ80TM9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
NischQ80TM9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
NischQ80TM9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
NischQ80TM9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.01■■■■□ 3.99
NischQ80TM9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
NischQ80TM9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
NischQ80TM9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
NischQ80TM9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
NischQ80TM9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
NischQ80TM9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
NischQ80TM9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
NischQ80TM9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
NischQ80TM9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
NischQ80TM9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
NischQ80TM9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
NischQ80TM9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
NischQ80TM9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
NischQ80TM9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
NischQ80TM9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
NischQ80TM9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
NischQ80TM9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
NischQ80TM9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
NischQ80TM9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
NischQ80TM9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC39.97■■■■□ 3.99
NischQ80TM9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
NischQ80TM9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
NischQ80TM9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
NischQ80TM9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
NischQ80TM9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
NischQ80TM9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
NischQ80TM9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
NischQ80TM9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC39.96■■■■□ 3.99
NischQ80TM9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
NischQ80TM9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
NischQ80TM9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
NischQ80TM9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
NischQ80TM9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
NischQ80TM9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
NischQ80TM9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
NischQ80TM9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
NischQ80TM9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
NischQ80TM9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC39.93■■■■□ 3.98
NischQ80TM9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
NischQ80TM9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
NischQ80TM9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
NischQ80TM9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
NischQ80TM9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
NischQ80TM9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
NischQ80TM9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
NischQ80TM9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
NischQ80TM9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
NischQ80TM9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
NischQ80TM9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
NischQ80TM9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
NischQ80TM9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms