Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdc42bpbQ7TT50 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdc42bpbQ7TT50 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdc42bpbQ7TT50 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdc42bpbQ7TT50 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdc42bpbQ7TT50 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdc42bpbQ7TT50 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdc42bpbQ7TT50 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdc42bpbQ7TT50 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdc42bpbQ7TT50 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdc42bpbQ7TT50 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdc42bpbQ7TT50 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdc42bpbQ7TT50 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdc42bpbQ7TT50 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdc42bpbQ7TT50 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdc42bpbQ7TT50 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdc42bpbQ7TT50 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdc42bpbQ7TT50 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdc42bpbQ7TT50 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdc42bpbQ7TT50 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdc42bpbQ7TT50 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdc42bpbQ7TT50 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdc42bpbQ7TT50 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdc42bpbQ7TT50 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdc42bpbQ7TT50 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdc42bpbQ7TT50 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cdc42bpbQ7TT50 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cdc42bpbQ7TT50 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cdc42bpbQ7TT50 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Cdc42bpbQ7TT50 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cdc42bpbQ7TT50 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cdc42bpbQ7TT50 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdc42bpbQ7TT50 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdc42bpbQ7TT50 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms