Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT37

Elp1, Elongator complex protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp1Q7TT37 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Elp1Q7TT37 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Elp1Q7TT37 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms