Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClmQ7TSN2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClmQ7TSN2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms