Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI3

Ppp6r1, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp6r1Q7TSI3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppp6r1Q7TSI3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp6r1Q7TSI3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms