Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctdp1Q7TSG2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctdp1Q7TSG2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctdp1Q7TSG2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctdp1Q7TSG2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctdp1Q7TSG2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctdp1Q7TSG2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctdp1Q7TSG2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctdp1Q7TSG2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctdp1Q7TSG2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctdp1Q7TSG2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctdp1Q7TSG2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctdp1Q7TSG2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctdp1Q7TSG2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctdp1Q7TSG2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctdp1Q7TSG2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctdp1Q7TSG2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctdp1Q7TSG2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctdp1Q7TSG2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctdp1Q7TSG2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctdp1Q7TSG2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctdp1Q7TSG2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctdp1Q7TSG2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctdp1Q7TSG2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctdp1Q7TSG2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctdp1Q7TSG2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctdp1Q7TSG2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctdp1Q7TSG2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctdp1Q7TSG2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctdp1Q7TSG2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctdp1Q7TSG2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms