Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphp3Q7TNH6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nphp3Q7TNH6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms