Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TwistnbQ78WZ7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms