Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Eci3Q78JN3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eci3Q78JN3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eci3Q78JN3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eci3Q78JN3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms