Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Efr3bQ6ZQ18 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efr3bQ6ZQ18 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms