Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ino80Q6ZPV2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ino80Q6ZPV2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms