Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPJ3

Ube2o, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme UBE2O, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2oQ6ZPJ3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ube2oQ6ZPJ3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms