Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cxcl3Q6W5C0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms