Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn5Q6VZZ7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.4 ms