Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ift172Q6VH22 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC26■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ift172Q6VH22 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms