Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neil2Q6R2P8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms