Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Bnip1Q6QD59 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bnip1Q6QD59 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms