Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nudcd1Q6PIP5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nudcd1Q6PIP5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms