Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rad54bQ6PFE3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rad54bQ6PFE3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms