Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gramd2bQ6PEM6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms