Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CtifQ6PEE2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtifQ6PEE2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 221.6 ms