Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhb9Q6PB60 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhb9Q6PB60 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhb9Q6PB60 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhb9Q6PB60 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhb9Q6PB60 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhb9Q6PB60 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhb9Q6PB60 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhb9Q6PB60 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhb9Q6PB60 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhb9Q6PB60 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhb9Q6PB60 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhb9Q6PB60 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhb9Q6PB60 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhb9Q6PB60 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhb9Q6PB60 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhb9Q6PB60 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhb9Q6PB60 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhb9Q6PB60 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhb9Q6PB60 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhb9Q6PB60 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhb9Q6PB60 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhb9Q6PB60 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhb9Q6PB60 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhb9Q6PB60 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhb9Q6PB60 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhb9Q6PB60 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhb9Q6PB60 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhb9Q6PB60 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhb9Q6PB60 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhb9Q6PB60 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhb9Q6PB60 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhb9Q6PB60 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhb9Q6PB60 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhb9Q6PB60 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhb9Q6PB60 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhb9Q6PB60 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhb9Q6PB60 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms