Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gapvd1Q6PAR5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Gapvd1Q6PAR5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gapvd1Q6PAR5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Gapvd1Q6PAR5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gapvd1Q6PAR5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gapvd1Q6PAR5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gapvd1Q6PAR5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gapvd1Q6PAR5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Gapvd1Q6PAR5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gapvd1Q6PAR5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gapvd1Q6PAR5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gapvd1Q6PAR5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gapvd1Q6PAR5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gapvd1Q6PAR5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Gapvd1Q6PAR5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Gapvd1Q6PAR5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gapvd1Q6PAR5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gapvd1Q6PAR5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gapvd1Q6PAR5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gapvd1Q6PAR5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gapvd1Q6PAR5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gapvd1Q6PAR5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gapvd1Q6PAR5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gapvd1Q6PAR5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gapvd1Q6PAR5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gapvd1Q6PAR5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gapvd1Q6PAR5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gapvd1Q6PAR5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gapvd1Q6PAR5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gapvd1Q6PAR5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gapvd1Q6PAR5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gapvd1Q6PAR5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gapvd1Q6PAR5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Gapvd1Q6PAR5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms