Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Atl2Q6PA06 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atl2Q6PA06 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atl2Q6PA06 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atl2Q6PA06 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atl2Q6PA06 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atl2Q6PA06 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atl2Q6PA06 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atl2Q6PA06 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atl2Q6PA06 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Atl2Q6PA06 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atl2Q6PA06 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atl2Q6PA06 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms