Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slf2Q6P9P0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slf2Q6P9P0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms