Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ0

Ccdc189, Coiled-coil domain-containing protein 189, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc189Q6NZQ0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc189Q6NZQ0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc189Q6NZQ0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms