Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms