Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gpbp1Q6NXH3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms