Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fndc3bQ6NWW9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fndc3bQ6NWW9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms