Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Arhgap20Q6IFT4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arhgap20Q6IFT4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arhgap20Q6IFT4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms