Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nckap5lQ6GQX2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nckap5lQ6GQX2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms