Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV7

Edrf1, Erythroid differentiation-related factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edrf1Q6GQV7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Edrf1Q6GQV7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Edrf1Q6GQV7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms