Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Smarca2Q6DIC0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Smarca2Q6DIC0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Smarca2Q6DIC0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms