Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIA9

Fbxo27, F-box only protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo27Q6DIA9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms