Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbf1Q6DFZ1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gbf1Q6DFZ1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gbf1Q6DFZ1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gbf1Q6DFZ1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Gbf1Q6DFZ1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gbf1Q6DFZ1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gbf1Q6DFZ1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gbf1Q6DFZ1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gbf1Q6DFZ1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gbf1Q6DFZ1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gbf1Q6DFZ1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gbf1Q6DFZ1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gbf1Q6DFZ1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gbf1Q6DFZ1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gbf1Q6DFZ1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gbf1Q6DFZ1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gbf1Q6DFZ1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gbf1Q6DFZ1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gbf1Q6DFZ1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gbf1Q6DFZ1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gbf1Q6DFZ1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gbf1Q6DFZ1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gbf1Q6DFZ1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gbf1Q6DFZ1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gbf1Q6DFZ1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gbf1Q6DFZ1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gbf1Q6DFZ1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gbf1Q6DFZ1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gbf1Q6DFZ1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gbf1Q6DFZ1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gbf1Q6DFZ1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gbf1Q6DFZ1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 310.2 ms