Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rftn1Q6A0D4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rftn1Q6A0D4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms