Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZP3

Pnkd, Probable hydrolase PNKD, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkdQ69ZP3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PnkdQ69ZP3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PnkdQ69ZP3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms