Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sptbn2Q68FG2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sptbn2Q68FG2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms