Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ino80dQ66JY2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ino80dQ66JY2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ino80dQ66JY2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ino80dQ66JY2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ino80dQ66JY2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ino80dQ66JY2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ino80dQ66JY2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ino80dQ66JY2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ino80dQ66JY2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ino80dQ66JY2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ino80dQ66JY2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ino80dQ66JY2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ino80dQ66JY2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ino80dQ66JY2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ino80dQ66JY2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ino80dQ66JY2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ino80dQ66JY2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ino80dQ66JY2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ino80dQ66JY2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ino80dQ66JY2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ino80dQ66JY2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ino80dQ66JY2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ino80dQ66JY2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ino80dQ66JY2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ino80dQ66JY2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ino80dQ66JY2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ino80dQ66JY2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms