Protein–RNA interactions for Protein: Q64HY3

Sp9, Transcription factor Sp9, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp9Q64HY3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Sp9Q64HY3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Sp9Q64HY3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Sp9Q64HY3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Sp9Q64HY3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Sp9Q64HY3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Sp9Q64HY3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Sp9Q64HY3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Sp9Q64HY3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Sp9Q64HY3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Sp9Q64HY3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp9Q64HY3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
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Sp9Q64HY3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp9Q64HY3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp9Q64HY3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp9Q64HY3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp9Q64HY3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp9Q64HY3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp9Q64HY3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp9Q64HY3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp9Q64HY3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp9Q64HY3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp9Q64HY3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp9Q64HY3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp9Q64HY3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp9Q64HY3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 298.4 ms