Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sdc3Q64519 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sdc3Q64519 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sdc3Q64519 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sdc3Q64519 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sdc3Q64519 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sdc3Q64519 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sdc3Q64519 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sdc3Q64519 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sdc3Q64519 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sdc3Q64519 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sdc3Q64519 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sdc3Q64519 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdc3Q64519 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sdc3Q64519 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sdc3Q64519 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sdc3Q64519 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sdc3Q64519 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sdc3Q64519 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sdc3Q64519 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sdc3Q64519 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sdc3Q64519 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdc3Q64519 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdc3Q64519 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdc3Q64519 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdc3Q64519 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms