Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col4a5Q63ZW6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col4a5Q63ZW6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms