Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tff3Q62395 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff3Q62395 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms