Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TrhQ62361 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TrhQ62361 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TrhQ62361 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TrhQ62361 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TrhQ62361 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TrhQ62361 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TrhQ62361 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TrhQ62361 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TrhQ62361 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TrhQ62361 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms