Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sall3Q62255 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sall3Q62255 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms