Protein–RNA interactions for Protein: Q62232

Six2, Homeobox protein SIX2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six2Q62232 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Six2Q62232 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Six2Q62232 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Six2Q62232 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Six2Q62232 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Six2Q62232 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Six2Q62232 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Six2Q62232 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Six2Q62232 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Six2Q62232 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Six2Q62232 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Six2Q62232 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Six2Q62232 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Six2Q62232 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Six2Q62232 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Six2Q62232 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Six2Q62232 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Six2Q62232 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Six2Q62232 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Six2Q62232 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Six2Q62232 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Six2Q62232 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Six2Q62232 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Six2Q62232 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Six2Q62232 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Six2Q62232 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Six2Q62232 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Six2Q62232 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Six2Q62232 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Six2Q62232 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Six2Q62232 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Six2Q62232 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Six2Q62232 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Six2Q62232 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Six2Q62232 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Six2Q62232 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Six2Q62232 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Six2Q62232 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Six2Q62232 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Six2Q62232 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms