Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms